Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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