Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms