Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FMODQ06828 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FMODQ06828 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
FMODQ06828 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FMODQ06828 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FMODQ06828 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FMODQ06828 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FMODQ06828 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FMODQ06828 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FMODQ06828 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FMODQ06828 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FMODQ06828 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FMODQ06828 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FMODQ06828 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FMODQ06828 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FMODQ06828 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FMODQ06828 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FMODQ06828 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FMODQ06828 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FMODQ06828 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms