Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP46P62068 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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USP46P62068 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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USP46P62068 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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USP46P62068 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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USP46P62068 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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