Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLCP48506 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLCP48506 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLCP48506 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLCP48506 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLCP48506 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLCP48506 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLCP48506 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLCP48506 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLCP48506 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLCP48506 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLCP48506 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLCP48506 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLCP48506 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLCP48506 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLCP48506 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLCP48506 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms