Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP13P45452 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP13P45452 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP13P45452 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP13P45452 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP13P45452 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP13P45452 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP13P45452 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP13P45452 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP13P45452 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP13P45452 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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