Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCAMP43121 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCAMP43121 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCAMP43121 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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