Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
USP8P40818 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP8P40818 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms