Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms