Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms