Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
IL3RAP26951 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms