Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PRKCHP24723 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PRKCHP24723 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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PRKCHP24723 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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PRKCHP24723 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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