Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms