Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RLBP1P12271 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms