Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VTNP04004 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VTNP04004 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms