Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms