Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMF1-BGLAPU3KQ54 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMF1-BGLAPU3KQ54 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMF1-BGLAPU3KQ54 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMF1-BGLAPU3KQ54 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms