Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23IPQ9Y6Y8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms