Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A4Q9Y6R1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms