Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USH1CQ9Y6N9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USH1CQ9Y6N9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USH1CQ9Y6N9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USH1CQ9Y6N9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USH1CQ9Y6N9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USH1CQ9Y6N9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USH1CQ9Y6N9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USH1CQ9Y6N9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USH1CQ9Y6N9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USH1CQ9Y6N9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USH1CQ9Y6N9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USH1CQ9Y6N9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms