Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNMT3AQ9Y6K1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms