Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDY1Q9Y6F8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDY1Q9Y6F8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDY1Q9Y6F8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDY1Q9Y6F8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDY1Q9Y6F8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms