Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC1Q9Y5R8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms