Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPO11Q9Y5K1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms