Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5C1

ANGPTL3, Angiopoietin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANGPTL3Q9Y5C1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ANGPTL3Q9Y5C1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms