Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF6Q9Y4K3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF6Q9Y4K3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms