Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC43.85■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC43.83■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
DCAF1Q9Y4B6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC43.77■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
DCAF1Q9Y4B6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC43.75■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
DCAF1Q9Y4B6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms