Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SF3B6Q9Y3B4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms