Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZDHHC9Q9Y397 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZDHHC9Q9Y397 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZDHHC9Q9Y397 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms