Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W6

TDRKH, Tudor and KH domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRKHQ9Y2W6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRKHQ9Y2W6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TDRKHQ9Y2W6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TDRKHQ9Y2W6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRKHQ9Y2W6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms