Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BTRCQ9Y297 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms