Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN11Q9UMQ6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms