Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
INO80Q9ULG1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
INO80Q9ULG1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
INO80Q9ULG1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms