Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms