Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA3Q9UL41 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA3Q9UL41 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms