Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYH13Q9UKX3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYH13Q9UKX3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms