Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3Q9UKS6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3Q9UKS6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms