Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXL4Q9UKA2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXL4Q9UKA2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXL4Q9UKA2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXL4Q9UKA2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXL4Q9UKA2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXL4Q9UKA2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms