Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCNL1Q9UK58 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms