Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY1

HSPB8, Heat shock protein beta-8, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB8Q9UJY1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSPB8Q9UJY1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB8Q9UJY1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms