Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC23Q9UJX2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms