Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms