Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMP5Q9UJQ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMP5Q9UJQ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMP5Q9UJQ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMP5Q9UJQ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMP5Q9UJQ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMP5Q9UJQ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMP5Q9UJQ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMP5Q9UJQ1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMP5Q9UJQ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMP5Q9UJQ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMP5Q9UJQ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMP5Q9UJQ1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMP5Q9UJQ1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMP5Q9UJQ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMP5Q9UJQ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMP5Q9UJQ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMP5Q9UJQ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMP5Q9UJQ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMP5Q9UJQ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMP5Q9UJQ1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMP5Q9UJQ1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMP5Q9UJQ1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMP5Q9UJQ1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMP5Q9UJQ1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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