Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PLXNA1Q9UIW2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNA1Q9UIW2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms