Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED13Q9UHV7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED13Q9UHV7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms