Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MLH3Q9UHC1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MLH3Q9UHC1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms