Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP4Q9UGJ1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms