Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
IFT172Q9UG01 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
IFT172Q9UG01 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms