Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R1BQ9UD71 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R1BQ9UD71 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP1R1BQ9UD71 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP1R1BQ9UD71 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP1R1BQ9UD71 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP1R1BQ9UD71 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP1R1BQ9UD71 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms