Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX1-2Q9UD57 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX1-2Q9UD57 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX1-2Q9UD57 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms